Ziraat Türkiye Kupası'nda gruplar belli oldu. Grup kuraları Türkiye Futbol Federasyonu'nun Riva'daki merkezinde çekildi. Ziraat Türkiye Kupası grup aşamasındaki 32 takım, dörderli 8 grupta çift devreli lig usulüne göre mücadele edecek. Müsabakalar sonucunda gruplarında ilk 2 sırayı alan takımlar, Son 16 Turu'na yükselecek. Gruplarda ilk maçlar 29, 30 Kasım ve 1 Aralık'ta oynanacak. Kupada grup aşaması 19 Ocak 2017 tarihinde oynanacak maçlarla tamamlanacak. Kura çekiminin ardından oluşan grup eşleşmeleri şöyle: A Grubu Kırklarelispor Şanlıurfaspor Gaziantepspor Osmanlıspor ... B Grubu Sancaktepe Belediyespor İnegölspor Çaykur Rizespor Kasımpaşa ... C Grubu Amed Sportif Faaliyetler Menemen Belediyespor Gençlerbirliği Fenerbahçe ... D Grubu Darıca Gençlerbirliği Boluspor Kayserispor Beşiktaş ... E Grubu 24 Erzincanspor Tuzlaspor Elazığspor Galatasaray ... F Grubu Yeni Amasyaspor Göztepe Sivasspor Medipol Başakşehir ... G Grubu Aydınspor 1923 Ümraniyespor Bursaspor Akhisar Belediyespor ... H Grubu Kızılcabölükspor Gümüşhanespor Trabzonspor Atiker Konyaspor